MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011991	TCG	2	6	25739	25744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109140
502	NC_011991	AAG	2	6	25765	25770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109140
503	NC_011991	CGA	2	6	25826	25831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109140
504	NC_011991	ATGGAA	2	12	25853	25864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222109140
505	NC_011991	GGC	2	6	25876	25881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109140
506	NC_011991	TGGA	2	8	25904	25911	25 %	25 %	50 %	0 %	222109140
507	NC_011991	GCG	2	6	25996	26001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109140
508	NC_011991	TTCT	2	8	26130	26137	0 %	75 %	0 %	25 %	222109140
509	NC_011991	CCAA	2	8	26191	26198	50 %	0 %	0 %	50 %	222109140
510	NC_011991	GTCG	2	8	26265	26272	0 %	25 %	50 %	25 %	222109140
511	NC_011991	CCG	2	6	26285	26290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109140
512	NC_011991	CGA	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109140
513	NC_011991	A	6	6	26313	26318	100 %	0 %	0 %	0 %	222109140
514	NC_011991	CAG	2	6	26371	26376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109140
515	NC_011991	CGG	2	6	26427	26432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109140
516	NC_011991	CAA	2	6	26480	26485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109140
517	NC_011991	CT	3	6	26491	26496	0 %	50 %	0 %	50 %	222109140
518	NC_011991	TCT	2	6	26637	26642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011991	CGG	2	6	26745	26750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109141
520	NC_011991	AGC	2	6	26860	26865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109141
521	NC_011991	TTG	2	6	26893	26898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109141
522	NC_011991	GGA	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109141
523	NC_011991	GAG	2	6	26983	26988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109141
524	NC_011991	CTG	2	6	27076	27081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109141
525	NC_011991	TAC	2	6	27085	27090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109141
526	NC_011991	GAA	2	6	27130	27135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109141
527	NC_011991	GAT	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109141
528	NC_011991	TCGT	2	8	27271	27278	0 %	50 %	25 %	25 %	222109141
529	NC_011991	TAC	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109141
530	NC_011991	ATG	2	6	27440	27445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109141
531	NC_011991	CGTT	2	8	27560	27567	0 %	50 %	25 %	25 %	222109141
532	NC_011991	ACC	2	6	27600	27605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109141
533	NC_011991	CGA	2	6	27678	27683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109141
534	NC_011991	GTT	2	6	27773	27778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011991	GTCG	2	8	27863	27870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011991	GCC	2	6	27949	27954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011991	GAA	2	6	28009	28014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011991	GCC	2	6	28019	28024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_011991	CCG	3	9	28075	28083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109142
540	NC_011991	TCG	2	6	28120	28125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109142
541	NC_011991	GAC	2	6	28233	28238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109142
542	NC_011991	CGT	2	6	28241	28246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109142
543	NC_011991	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	222109142
544	NC_011991	TCC	2	6	28390	28395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109142
545	NC_011991	GAC	2	6	28437	28442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109142
546	NC_011991	ACCG	2	8	28636	28643	25 %	0 %	25 %	50 %	222109142
547	NC_011991	GCGA	2	8	28654	28661	25 %	0 %	50 %	25 %	222109142
548	NC_011991	TCGA	2	8	28720	28727	25 %	25 %	25 %	25 %	222109142
549	NC_011991	ACC	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109142
550	NC_011991	CGT	2	6	28799	28804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109142
551	NC_011991	CGG	2	6	28805	28810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109142
552	NC_011991	AGG	2	6	28852	28857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109142
553	NC_011991	TCC	2	6	28900	28905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109142
554	NC_011991	A	6	6	28944	28949	100 %	0 %	0 %	0 %	222109142
555	NC_011991	CGC	2	6	28964	28969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109142
556	NC_011991	GC	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	222109142
557	NC_011991	GTC	2	6	29025	29030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109142
558	NC_011991	CCA	2	6	29234	29239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109142
559	NC_011991	TC	3	6	29264	29269	0 %	50 %	0 %	50 %	222109142
560	NC_011991	GCG	2	6	29281	29286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109142
561	NC_011991	GATC	2	8	29288	29295	25 %	25 %	25 %	25 %	222109142
562	NC_011991	TCT	2	6	29306	29311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109142
563	NC_011991	GTC	2	6	29326	29331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109142
564	NC_011991	TCCT	2	8	29488	29495	0 %	50 %	0 %	50 %	222109142
565	NC_011991	GAAT	2	8	29585	29592	50 %	25 %	25 %	0 %	222109142
566	NC_011991	GAG	2	6	29754	29759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109142
567	NC_011991	CGA	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
568	NC_011991	GC	3	6	29882	29887	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
569	NC_011991	TCA	2	6	30049	30054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
570	NC_011991	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
571	NC_011991	GTTG	2	8	30109	30116	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
572	NC_011991	ACG	2	6	30138	30143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
573	NC_011991	CGG	2	6	30226	30231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
574	NC_011991	TGCC	2	8	30243	30250	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
575	NC_011991	ACCC	2	8	30398	30405	25 %	0 %	0 %	75 %	222109143
576	NC_011991	GAC	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
577	NC_011991	GA	3	6	30487	30492	50 %	0 %	50 %	0 %	222109143
578	NC_011991	CGG	2	6	30496	30501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
579	NC_011991	CGC	2	6	30538	30543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
580	NC_011991	ACC	2	6	30561	30566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
581	NC_011991	AGC	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
582	NC_011991	T	6	6	30637	30642	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
583	NC_011991	CT	3	6	30643	30648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109143
584	NC_011991	TTC	2	6	30680	30685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
585	NC_011991	CAA	2	6	30716	30721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109143
586	NC_011991	ATC	2	6	30728	30733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
587	NC_011991	AGGT	2	8	30767	30774	25 %	25 %	50 %	0 %	222109143
588	NC_011991	TCGCG	2	10	30799	30808	0 %	20 %	40 %	40 %	222109143
589	NC_011991	CAG	2	6	30809	30814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
590	NC_011991	CGT	2	6	30832	30837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
591	NC_011991	T	7	7	30841	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
592	NC_011991	GAT	2	6	30856	30861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109143
593	NC_011991	CAG	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
594	NC_011991	CAG	2	6	30911	30916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
595	NC_011991	GCC	2	6	30951	30956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
596	NC_011991	CGA	2	6	30961	30966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
597	NC_011991	ATC	2	6	30996	31001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
598	NC_011991	GAG	2	6	31017	31022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109143
599	NC_011991	GTC	2	6	31023	31028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
600	NC_011991	GCC	2	6	31092	31097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
601	NC_011991	TCG	2	6	31230	31235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
602	NC_011991	CGTT	2	8	31241	31248	0 %	50 %	25 %	25 %	222109143
603	NC_011991	CTC	3	9	31295	31303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109143
604	NC_011991	GT	3	6	31315	31320	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
605	NC_011991	AGGT	2	8	31395	31402	25 %	25 %	50 %	0 %	222109143
606	NC_011991	GGC	2	6	31416	31421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
607	NC_011991	GGC	2	6	31466	31471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
608	NC_011991	TGCC	2	8	31489	31496	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
609	NC_011991	CAT	2	6	31531	31536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
610	NC_011991	GCTC	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
611	NC_011991	CGG	2	6	31647	31652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
612	NC_011991	AGT	2	6	31666	31671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109143
613	NC_011991	CTT	2	6	31709	31714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
614	NC_011991	CGA	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
615	NC_011991	GC	3	6	31806	31811	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
616	NC_011991	CGT	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
617	NC_011991	CGG	3	9	31846	31854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
618	NC_011991	TCG	2	6	31881	31886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
619	NC_011991	ACC	2	6	31908	31913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
620	NC_011991	ACC	2	6	31917	31922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
621	NC_011991	TGG	2	6	32035	32040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109143
622	NC_011991	CGC	2	6	32193	32198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
623	NC_011991	TGC	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
624	NC_011991	TCA	2	6	32232	32237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
625	NC_011991	GCC	2	6	32388	32393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
626	NC_011991	TTC	2	6	32468	32473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
627	NC_011991	CGT	2	6	32509	32514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
628	NC_011991	GCG	2	6	32527	32532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
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759	NC_011991	TGC	2	6	40338	40343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
760	NC_011991	TC	3	6	40346	40351	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
761	NC_011991	TCG	2	6	40424	40429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
762	NC_011991	CTT	2	6	40467	40472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109151
763	NC_011991	GTC	2	6	40519	40524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
764	NC_011991	GGGCC	2	10	40539	40548	0 %	0 %	60 %	40 %	222109151
765	NC_011991	TCGCA	2	10	40674	40683	20 %	20 %	20 %	40 %	222109151
766	NC_011991	ATCA	2	8	40714	40721	50 %	25 %	0 %	25 %	222109151
767	NC_011991	GCCA	2	8	40778	40785	25 %	0 %	25 %	50 %	222109151
768	NC_011991	CTG	2	6	40789	40794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
769	NC_011991	CGA	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
770	NC_011991	GCTG	2	8	40817	40824	0 %	25 %	50 %	25 %	222109151
771	NC_011991	CGAG	2	8	40887	40894	25 %	0 %	50 %	25 %	222109151
772	NC_011991	CTC	2	6	40901	40906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109151
773	NC_011991	GCTG	2	8	40941	40948	0 %	25 %	50 %	25 %	222109151
774	NC_011991	TTG	2	6	40996	41001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109151
775	NC_011991	GCG	2	6	41014	41019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
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777	NC_011991	CCG	2	6	41192	41197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
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780	NC_011991	GCT	2	6	41359	41364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
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782	NC_011991	GTC	2	6	41491	41496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
783	NC_011991	GC	3	6	41509	41514	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
784	NC_011991	AGA	2	6	41525	41530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109151
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786	NC_011991	ACCG	2	8	41575	41582	25 %	0 %	25 %	50 %	222109151
787	NC_011991	CAA	2	6	41610	41615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
788	NC_011991	ATC	2	6	41713	41718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
789	NC_011991	GGC	2	6	41856	41861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
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792	NC_011991	GC	3	6	41934	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
793	NC_011991	CG	3	6	41953	41958	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
794	NC_011991	CAT	3	9	41979	41987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
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802	NC_011991	TCG	2	6	42218	42223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
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804	NC_011991	CCGG	2	8	42353	42360	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
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848	NC_011991	CATC	2	8	44766	44773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
849	NC_011991	CGC	2	6	44909	44914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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874	NC_011991	ACC	2	6	45672	45677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109154
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879	NC_011991	CGCA	2	8	45869	45876	25 %	0 %	25 %	50 %	222109154
880	NC_011991	CGG	2	6	45995	46000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
881	NC_011991	TCT	2	6	46073	46078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109155
882	NC_011991	CAG	2	6	46143	46148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109155
883	NC_011991	GGCG	2	8	46175	46182	0 %	0 %	75 %	25 %	222109155
884	NC_011991	GTC	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109155
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